با‌توجه به‌حرکت رو به‌ر شد دانش و فناوری در صنعت آب و به‌منظور تامین نیروی متخصص مورد‌نیاز این صنعت جهت مطالعه طراحی و نگهداری تاسیسات آبی و بهره­‌برداری از سد و شبکه­‌های آبیاری و زهکشی و همچنین شناخت و مطالعات منابع آب، گروه مهندسی آب در سال 1364 فعالیت­‌های آموزشی خود را با‌ ارائه آموزش‌­های تخصصی و کوتاه‌مدت آغاز نمود. در سال 1367 با‌پذیرش دانشجو در رشته کاردانی عمران- بهره‌برداری از منابع آب، فعالیت­‌های آموزشی بلند‌مدت در این گروه شکل گرفت. در سال 1370 در سه رشته مهندسی علمی كاربردي عمران - ساختمان­‌های‌آبی، عمران مهندسی آب و فاضلاب و عمران - مهندسی بهره‌­برداری از سد و شبكه اقدام به‌ پذيرش دانشجو از طريق كنكور سراسری نمود. به‌دنبال تبدیل دانشکده به‌ دانشگاه در سال 1383، دانشکده مهندسی آب براساس ساختار جدید دانشگاه، شکل گرفت. در سال 1384 دانشكده مهندسی آب مشتمل بر‌چهار گروه مهندسی آب و فاضلاب، مهندسی محیط زیست، مهندسی سازه و ژئوتكنيك و مهندسی منابع  آب تشكيل‌ گرديده و همواره به‌دنبال اجرای برنامه‌ها و اهداف خود به‌نحوی مطلوب از قبیل ارائه دوره‌های بلند‌مدت کارشناسی و تحصیلات‌تکمیلی، ارائه دوره‌های تخصصی مورد‌نیاز صنایع، مشاوره صنعتی، فعالیت‌های پژوهشی، ارائه فعالیت‌های تخصصی با مشارکت موسسات دیگر و مشاوره در امور تصمیمی سازی صنعتی و مدیریتی بوده است. به‌طور کلی هدف دانشکده از اجرای دوره‌های مختلف علمی و کاربردی در سطوح مختلف، آموزش دانشجویان و آشنا‌نمودن آنها با‌ تکنولوژی‌های گوناگون صنعت آب بوده، تا دانش‌آموختگان این رشته توانایی و قابلیت لازم در زمینه‌های مختلف صنعت آب را به‌دست آورند. هم‌اکنون دانشکده مهندسی عمران، آب و محیط زیست مشتمل بر چهار گروه مهندسی آب، فاضلاب و محيط زيست، مهندسی منابع آب، مهندسی سازه و زلزله، مهندسی ژئوتکنیک، و حمل و نقل بوده  و دانش‌آموختگان این رشته‌ها با‌حضور در بخش‌های مختلف طراحی، اجرا، بهره‌برداری و نگهداری صنعت آب و نشان‌دادن توانایی و شایستگی خود در موارد اجرایی، مطالعاتی، مدیریتی و مشاوره‌ای نقش مهمی را ایفا می‌نمایند.